Links between bacterial diversity and carbon cycling in the sea

Resumen

pesar del gran avance en nuestro conocimiento sobre la diversidad bacteriana marina y el papel de las bacterias en el ciclo de carbono oceánico, aún se sabe muy poco sobre la relación entre estas dos importantes características en condiciones naturales. El estudio de esta relación se ha visto impedido por la gran dificultad para obtener cultivos puros de bacterias representativas del medio marino, lo que nos permitiría disponer de información sobre sus capacidades metabólicas. El reciente desarrollo de técnicas de resolución individual (single-cell) ha permitido el estudio de la actividad de poblaciones bacterianas in situ, permitiendo grandes avances en este campo. Estamos comenzando a conocer cual es el papel de grupos específicos de bacterias en el ciclo de carbono, y la relación entre la estructura de la comunidad bacteriana y la magnitud global de ciclo de carbono en el océano. En esta tesis, se estudia la relación entre diversidad bacteriana y función a lo largo de dos gradientes en aguas marinas: un gradiente temporal (estudio estacional en una estación costera del Mediterráneo), y un gradiente espacial que cubre diferentes estados tróficos en aguas oceánicas (desde el afloramiento de Cabo Blanco hasta el giro subtropical del Atlántico Norte). Primeramente, se ha descrito exhaustivamente la estructura de la comunidad bacteriana en ambos lugares de muestreo, utilizando simultáneamente diversas técnicas geneticas como bibliotecas génicas, hibridación in situ con sondas fluorescentes y "fingerprint" de genes que codifican el RNA ribosomico 16S. También se ha estudiado exhaustivamente el uso bacteriano de carbono a lo largo de ambos gradientes, con especial enfásis en la identificación y restricción de las limitaciones en las metodologías utilizadas. Tras estos estudios descriptivos, se llevaron a cabo estudios comparativos en los que los cambios en la estructura de la comunidad bacteriana fueron sistemáticamente comparados a los