Comprehensive analysis of Pseudomonas aeruginosa oleate-diol synthase activity

  1. Estupiñán Romero, Mónica
Dirigida por:
  1. Pilar Díaz Lucea Director/a
  2. Maria Àngels Manresa Presas Director/a

Universidad de defensa: Universitat de Barcelona

Fecha de defensa: 20 de noviembre de 2015

Tribunal:
  1. Laura Baldoma Presidente/a
  2. Marian Llamas Lorente Secretario/a
  3. Ulrike Garscha Vocal

Tipo: Tesis

Teseo: 398097 DIALNET

Resumen

Comprehensive analysis of Pseudomonas aeruginosa oleate-diol synthase activity The discovery of new biotechnological applications of hydroxy fatty acids such as the oxylipins, has provided the basisto explore new mechanisms of oxylipin biosynthesis in prokaryotes, as no evidence on the occurrence of oxylipin production in bacteria existed for a long time. In 2010, a diol synthase activity was biochemically characterized in Pseudomonas aeruginosa 42A2, an environmental strain isolated from oily-waste water, which enables accumulation oxylipins in the extracellular medium. This rare diol synthase activity has been described for the first time in bacteria, generating oxylipins with interesting properties by oxygenation of monounsaturated fatty acids, preferentially oleic acid. The catalytic mechanism proceeds through the dioxygenation of oleic acid to release (10S)-hydroperoxy-(8E)-octadecenoic acid (10S-HPOME), which is reduced to (10S)-hydroxy-(8E)-octadecenoic acid (10S-HOME) through a secondary non-enzymatic reaction, followed by conversion of the hydroperoxide intermediate into (7S,10S)-dihydroxy-(8E)-octadecenoic acid (7,10-DiHOME).However, the genes involved in oxylipin biosynthesis and transport to the extracellular medium, and the biological relevance of these metabolites in this bacterium remained unknown. The current work reports the first outer membrane transporter of oxylipins in P. aeruginosa, the ExFadLO, and identifies the operon structure of the genes coding for two previously uncharacterized enzymes involved in oleate-diol synthase activity, acting sequentially as oleic acid dioxygenase (10S-DOX) and hydroperoxide isomerase or diol synthase (7,10-DS) activities. These proteins belong to a new subfamily of bacterial enzymes, designated as FadCCPs, only found among P. aeruginosa species. Insights into this unique oleate-diol synthase metabolic route evolutionary pathway, and the possible biological relevance of oxylipin biosynthesis and metabolism in P. aeruginosa are discussed. Moreover, a biotechnological approach to P. aeruginosa oleate-diol synthase activity for oxylipin production is proposed. RESUMEN Estudio global de la actividad oleato diol sintasa en Pseudomonas aeruginosa El descubrimiento de nuevas aplicaciones biotecnológicas de ácidos grasos hidroxilados tales como las oxilipinas, ha proporcionado las bases para explorar nuevos mecanismos de biosíntesis de oxilipinas en procariotas, ya que durante mucho tiempo no hubo evidencias sobre la producción de oxilipinas en bacterias. En 2010, se caracterizó bioquímicamente la actividad diol sintasa en Pseudomonas aeruginosa 42A2, una cepa del medio ambiente aisladaen aguas contaminadas con residuos oleaginosos, capaz de acumular oxilipinas en el medio extracelular. Esta actividad diol sintasa ha sido descrita por primera vez en bacterias, posibilitando la obtención de oxilipinas con propiedades interesantes mediante la oxigenación de ácidos grasos monoinsaturados, preferentemente el ácido oleico. El mecanismo catalítico descrito tiene lugar a través de la dioxigenación de ácido oleico para liberar ácido (10S)-hidroperoxi-(8E)-octadecenoico (10S-HPOME), que se reduce al ácido (10S)-hidroxi-(8E)-octadecenoico (10S-HOME) a través de una reacción secundaria no enzimática, seguido por la conversión del intermediario hidroperóxido a ácido (7S,10S)-dihidroxi-(8E)-octadecenoico (7,10-DiHOME). Sin embargo, los genes implicados en la biosíntesis de oxilipinas y su transporte al medio extracelular, así como la relevancia biológica de estos metabolitos en esta bacteria eran desconocidos. El presente trabajo describe el primer transportador de membrana externa de oxilipinas en P. aeruginosa, la proteína ExFadLO, e identifica el operón cuyos genes codifican dos enzimas no caracterizadas hasta el momento, que participan en la actividad oleato diol sintasa actuando de forma secuencial mediante las actividades dioxigenasa del ácido oleico (10S-DOX) e hidroperóxido isomerasa o diol sintasa (7,10-DS). Estas proteínas pertenecen a una nueva subfamilia de enzimas bacterianas, designadas como FadCCPs, distribuidas únicamente entre las especies de P. aeruginosa. Además, se discuten nuevos aspectos en torno a la vía evolutiva de la ruta metabólica oleato diol sintasa,y la posible relevancia biológica de la biosíntesis de oxilipinas y su metabolismo en P. aeruginosa. Por último, se propone una aproximación biotecnológica de la actividad oleato diol sintasa de P. aeruginosa para la producción de oxilipinas.