Identification of candidate genes involved in the response to different abiotic stresses in potato (Solanum tuberosumL.)
- L. Barandalla
- A. Álvarez
- J.I. Ruiz de Galarreta
- E.Ritter
ISSN: 1019-6609, 1853-4961
Año de publicación: 2018
Volumen: 22
Número: 2
Páginas: 33-38
Tipo: Artículo
Otras publicaciones en: Revista Latinoamericana de la Papa
Resumen
Las plantas que crecen en hábitats naturales están expuestas a múltiples estreses ambientales resultantes de factores abióticos como el calor, la sequía y el frío, que tienen un impacto significativo en la papa cultivada. Se ha evaluado en dos variedades de Solanum tuberosumL. Soprano y Kondor, la adaptación a diferentesestreses abióticos como calor, frío y sequía. Para ello, las plantas de ambas variedades fueron estresadas y cuando mostraron síntomas se llevó a cabo la extracción de ARN y se construyó una biblioteca de ADNc para cada muestra. El objetivo de este estudio fue detectar y analizar los genes involucrados en las respuestas al estrés abiótico en papa. El ensayo generó secuencias de transcriptomas de ambas variedades, con un total de 5579655 lecturas y 8420 genes candidatos posibles. 4027 de los genes candidatos fueron polimórficos y presentaron un número diferente de patrones definidos por un número variable de SNPs. Muchos de los genes candidatos generados mostraron una expresión diferencial, ya que el gen candidato estaba presente en la planta estresada, pero no en la control. La aplicación de esta metodología nos permite detectar numerosos genes candidatos o combinaciones específicas de alelos, que se expresan diferencialmente después de la aplicación de diferentes estreses abióticos. Esto será útil para identificar alelos superiores que se pueden usar en la Selección Asistida por Marcadores para la resistencia y tolerancia a estreses abióticos
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