La filogenia PrimateUn protocolo de prácticas.

Resumen

Objetivo: Se propone la impartición de una clase práctica de análisis de datos genómicos, en la que se revisa la filogenia del orden de los primates. Materiales y métodos: A partir de las secuencias de 54 genes correspondientes a 186 especies de primates se realizan una serie de análisis filogenéticos mediante diferentes algoritmos. En primer lugar, se comparan los resultados obtenidos mediante cinco métodos (Máxima Verosimilitud, Unión de Vecinos, Evolución Mínima, UPGMA y Máxima Parsimonia) para el conjunto del orden Primate. Después, se profundiza en el análisis por separado de Strepsirrhini y Haplorrhini (Platyrrhini y Catarrhini). Con el fin de facilitar la identificación visual de los diferentes géneros de primates, se ha desarrollado un programa (GEH), que muestra imágenes tanto de cada especimen como de su distribución geográfica. Actividades: En el informe final de la actividad se valorarán los algoritmos filogenéticos, seleccionándose el método que ofrezca el árbol más verosímil a partir de los conocimientos adquiridos previamente sobre los diferentes grupos de primates. Se valorará asimismo la robustez de las diferentes ramas a la luz de los valores bootstrap obtenidos. En los análisis de Strepsirrhini, Platyrrhini y Catarrhini, se interpretarán las agrupaciones de géneros en los respectivos árboles. Finalmente, se discutirán las características morfológicas diferenciales más llamativas y la distribución geográfica de cada grupo.