Identificación de perfiles diferenciales de expresión molecular en astrocitomas humanos
- LEIS ESNAOLA, OLATZ
- José Vicente Lafuente Sánchez Director
- J. Margareto Co-director
Defence university: Universidad del País Vasco - Euskal Herriko Unibertsitatea
Fecha de defensa: 28 November 2008
- Luis Martínez Millán Chair
- Iñigo Pomposo Gastelu Secretary
- José Rafael Iglesias Rozas Committee member
- Jesús Garibi Undabarrena Committee member
- Félix F. Cruz Sánchez Committee member
Type: Thesis
Abstract
La identificación de la combinación adecuada de diferentes biomarcadores clínicos, inmunológicos y genéticos permitirá establecer indicaciones terapeúticas personalizadas, reduciendo los efectos secundarios y mejorando el pronóstico de los gliomas, tanto en relación a la supervivencia como a la calidad de vida. El objetivo general es caracterizar perfiles clínico-moleculares de gliomas astrocitarios en los extremos diagnósticos de malignidad (astrocitoma de bajo grado y glioblastoma multiforme), analizando regiones homogéneas mediante la obtención de material estrictamente protocolizado, el diagnóstico contrastado y la obtención de la información molecular. Para la caracterización molecular se empleará la metodología de microarrays de ADN, para el estudio de las variaciones del número de copias de DNA genómico en estos tumores (CGH-arrays). Los datos de expresión proteica mediante metodología de matrices de anticuerpos, siendo los resultados validados por Western Blot todo ello realizado a partir de los mismos casos. Con todos los datos obtenidos se llevan a cabo análisis de perfiles diferenciales de expresión por aplicaciones informáticas específicas basadas en Redes Neuronales artificiales. Un análisis contrastado de las 3 metodologías utilizadas en este estudio nos puede dar una idea de las vías de señalización que se activan o inhiben a lo largo del proceso tumoral. Cuando contrastamos los datos de expresión génica con los datos del número de copias de ADN, encontramos sobreexpresión y amplificación para el gen TXNIP en el grupo de GBM. Algunos autores consideran que el TXNIP puede estar actuando como un gen supresor de metástasis tumoral pueden estar relacionados con la baja actividad metastatizante que muestran los GBM. También se encontró sobreexpresión génica y sobreexpresión proteica en los GBM para moléculas implicadas en procesos de remodelación de la MEC, moléculas como la ITB3 y la ITGA5. Es interesante señalar la amplificación del gen CDK4, ya que se encontró una sobreexpresión del mismo en el grupo de los GBM. Este gen promueve el paso del ciclo celular Se identificó una amplificación génica en una región donde se alojaba el gen sobreexpresado en los GBM denominado APOE que podría estar afectando al tráfico lipídico en las células tumorales. También encontramos amplificación para el gen AKT2 que favorecería la actividad proliferativa de estos tumores favorecida por la sobreexpresión génica y proteica encontrada en los GBM para la familia antiapoptótica Bcl-2, implicada en procesos de resistencia a quimioterápicos.