Obtención de un mapa genético, construcción de una genoteca de bacs y detección de genes de respuesta a factores bióticos y abióticos en vid

Resumen

El trabajo fundamental de esta tesis consiste en la obtención de un mapa funcional en vid (Vitis vinifera L.). Para ello se ha elaborado un mapa genético a partir de un cruzamiento controlado entre las variedades Monastrell y Cabernet Sauvignon. Los marcadores moleculares utilizados para la construcción del mapa han sido AFLPs y SSRs. Los AFLPs han permitido por una parte desarrollar el armazón del mapa genético mientras que los SSRs además han posibilitado comparar este mapa con mapas de vid anteriormente publicados. Para dar un sentido cuantitativo al mapa, se ha desarrollado un análisis QTL (Quantitative Trait Loci) para caracteres importantes en vid de vinificación, durante dos años consecutivos. Estos QTLs se han integrado en el mapa genético y se han estudiado las posibles relaciones existentes entre diferentes QTLs, así como entre QTLs y marcadores moleculares. Con el fin de detectar genes/cDNAs candidato de respuesta frente a factores bióticos y abióticos se realizó un experimento de expresión diferencial frente al ataque de oídio (Uncinula necator), y frente a déficit hídrico, utilizando la técnica de cDNA-AFLP. Los datos obtenidos sirvieron además, para generar cebadores candidato de respuesta a estos estreses. De esta forma, dos cDNAs candidato de respuesta frente a déficit hídrico pudieron integrarse en el mapa genético. Para finalizar se generó una genoteca de clones BAC (Bacterial Artificial Chromosome), a partir del progenitor Monastrell. Esta genoteca supone un primer paso hacia la construcción de un mapa físico de vid, y posibilita el trabajo in situ con clones específicos del genoma de la vid.