Automatización de la adquisición y procesamiento de datos en microscopía electrónica tridimensional
- Aitor J. Garrido Hernández Zuzendaria
- Izaskun Garrido Hernandez Zuzendarikidea
Defentsa unibertsitatea: Universidad del País Vasco - Euskal Herriko Unibertsitatea
Fecha de defensa: 2016(e)ko urtarrila-(a)k 11
- Manuel de la Sen Parte Presidentea
- Rafael Bárcena Ruiz Idazkaria
- Adriana Rojas Cardona Kidea
- Carmen San Martín Pastrana Kidea
- Juan Manuel García Chamizo Kidea
Mota: Tesia
Laburpena
La presente tesis ha sido realizada en la unidad de biología estructural del Centro de Investigación Cooperativa en biociencias (CIC bioGUNE) en colaboración con el Grupo de Control Automático (GCA) del departamento de Ingeniería de Sistemas y Automática de la Universidad de País Vasco (UPV/EHU). Esta tesis se centra en el desarrollo de un nuevo esquema de control inteligente utilizando diferentes algoritmos de inteligencia artificial para automatizar la adquisición de datos en un TEM dedicado a experimentos de cryo-EM. Este trabajo ha sido realizado utilizando el equipamiento de la plataforma de microscopía electrónica del CIC bioGUNE, especializada en el análisis de muestras a temperaturas criogénicas con el microscopio electrónico de transmisión modelo JEM-2200FS/CR de la compañía Jeol. El esquema de control inteligente permite el control remoto del microscopio y la monitorización en tiempo real del proceso de adquisición y análisis de las imágenes en una sesión cryo-TEM en modo automático. Uno de los objetivos de este trabajo es que el sistema de control inteligente lleve a cabo la misma tarea y de forma similar a cómo lo realizaría un microscopista experto en sesiones cryo-TEM, evaluando la calidad de las imágenes en tiempo real.